Sarana Dan Prasarana

Musholla Al Ikhlas
Pembelajaran di SD Negeri Warungboto Yogyakarta selalu menyeimbangkan tiga ranah pendidikan yaitu, kognisi, afeksi, dan psikomotor. Guna pembelajaran afeksi terutama penanaman keimanan dan ketaqwaan kepada para siswa maka SD Negeri Warungboto Yogyakarta dilengkapi dengan sebuah mushola.

Ruang Kelas 
Ruang kelas yang nyaman menambah semangat siswa-siswi dalam mengikuti proses belajar mengajar.

Ruang Rapat/Kegiatan
Ruang yang representatif untuk kegiatan rapat, seminar dan alternatif ruang belajar siswa. Sangat nyaman dengan ruangan yang dilengkapi dengan LCD proyektor 

Lab. Komputer & Multimedia
Di era serba teknologi ini, sangat penting untuk anak-anak bisa belajar komputer. Pembelajaran ini sebagai bekal yang bermanfaat bagi siswa kelak di masa depannya.

Unit Kesehatan Sekolah
Merupakan tempat untuk memberikan bantuan pengobatan bagi murid ataupun karyawan yang sedang tidak enak badan. UKS SD Negeri Warungboto Yogyakarta ini memberikan pelayanan yang sangat membantu mereka yang membutuhkan pertolongan pertama.